Každoročním vyvrcholením aktivit studentů v této oblasti je uskutečnění vědecké konference, která umožňuje formou soutěže srovnání dosažených výsledků, výměnu poznatků, zkušeností a rovněž možnost navázání nových kontaktů, především se studenty ze zahraničí.

Vědecká konference studentů je každoročně pojata jako „otevřená“ a tak se do ní se svými pracemi přihlásili i studenti, kteří v daném roce nebyli zapojeni do vědecké práce jako pomocné vědecké, či pedagogické síly. V letošním roce se vědecká konference uskutečnila ve dvou termínech.

V prvním termínu, dne 12. května 2009, proběhla soutěž v šesti soutěžních sekcích: „Aplikovaná matematika a informatika“, „Aplikované ekonomické disciplíny“, „Ekonomická teorie, právo a personalistika“, „Ochrana obyvatelstva“, „Bezpečnost prostředí“, „Vojenské vědy a management“. V průběhu soutěže bylo prezentováno celkem 36 soutěžních prací studentů fakulty a 10 prací zahraničních studentů.  

Spolu se studenty FEM se konference v prvním kole zúčastnili studenti vojenských univerzit a vysokých škol z Bulharska, Maďarska, Rumunska a Slovenska. Zahraniční studenti získali v daných sekcích celkem dvě první a tři třetí místa. Všichni zahraniční studenti dostali, kromě diplomů a čestných uznání, rovněž propagační materiál o UO a FEM, který jim bude připomínat jejich účast na této konferenci.

Ve druhém termínu, dne 20. května 2009, proběhla soutěž v sekcích „Logistika armády“ a „Služby logistiky“. Prezentováno bylo celkem 20 soutěžních prací studentů fakulty.

Nejpočetněji byly obsazeny sekce „Ochrana obyvatelstva“, a „Ekonomická teorie, právo a personalistika“.

Poznatky z jednotlivých sekcí potvrdily u většiny soutěžících velmi dobrou úroveň předložených prací a rovněž schopnost talentovaných studentů efektivně přispívat k celkovému rozvoji oblasti vědy a výzkumu na fakultě.